马耳他属申根协议国，其签证主要分为外交、商务、旅游、学习、探亲访友、工作和结婚签证等。除马耳他在北京和上海的两处签证申请中心外，自2017年9月起，沈阳、西安、济南、武汉、长沙、成都、重庆、昆明、南京、杭州、广州、深圳、福州马耳他签证申请中心均已由马耳他驻华大使馆授权，正式受理持有普通护照的申请人各种类型的签证申请、代收签证费用，并提供护照返还的服务。具体联系方式及申请材料，请参阅马耳他签证申请中心网站：https://visa.vfsglobal.com/chn/zh/mlt
根据中马双边协议，持有效外交、公务护照(不含公务普通护照)的中国公民，可从马耳他免签入境、过境或出境，停留不超过30天。如需经欧盟申根区其他国家转机来马或离马，请提前办妥有关国家过境或入出境申根签证。根据中欧双边协定，持有效外交护照的中国公民，可免签从欧盟申根区任一成员国入出境或过境，在欧盟申根区每180天内停留不超过90天。持香港或澳门特区护照者可免签入境马耳他并停留不超过90天。
自非申根区入境马耳他时，中国公民应当选择“其他护照通道”（Other Passports）办理入境手续，备好有效护照、签证、以及与入境有关的文件证明，以便边境移民官员查验。如遇困难，可向移民官当面表达意见，同时要求与中国使馆联系。自申根区入境马耳他无需办理入境手续。
如马耳他为中国公民离开欧盟最后一个国家，离境时可申请返还在欧盟购物增值税。办理时需出示商店开具的退税收据，填写表格，并出示商品备查。如下一目的地仍为欧盟国家，届时一并办理。
